Conferencias, I Congreso Internacional de Ciencias Naturales y Aplicadas

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ASPECTOS ESTRUCTURALES Y MECANÍSTICOS DE LA ENZIMA DAPE DE LAS BACTERIAS ESKAPEE
Manuel Terrazas-López, Ángel Gabriel Díaz-Sánchez

Construir: Centro Cultural Universitario
Sala: Teatro Gracia Pasquel
Fecha: 2023-11-27 02:40 PM – 03:00 PM
Última modificación: 2023-11-19

Resumen


La multirresistencia bacteriana a antibióticos farmacéuticos es un problema emergente serio. Particularmente, las bacterias Enteroccus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiela pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp., y Escherichia coli, denomindas ESKAPEE, son una alarma preocupante. Una estrategia para la solución del problema es la identificación de blancos farmacológicos no explotados para el control bacteriano. Aunque, DapE es un reconocido blanco a este respecto, el descubrimiento y desarrollo de quimioterapias anti-DapE requiere de un estudio profundo de las propiedades fisicoquímicas de la enzima y de los inhibidores. DapE es una N-succinilasa, dimérica estricta, dependiente de dos centros metálicos de zinc (CM1 y CM2), que cataliza la amido-hidrólisis del N-succinil-L,L-2,6- diaminopimelado en succinato y L,L-diaminopimelato. Esta reacción proporciona la única fuente de meso-diaminopimelato y L-Lisina, que son componentes esenciales para la formación del peptidoglicano. Los detalles cristalográficos y bioquímicos de las DapE sugieren que la reacción es facilitada por un ajuste inducido que ocurre después de la unión del sustrato, produciendo el ensamble del agujero del oxianión. Los centros metálicos y la base general permanecen inmóviles durante el ciclo, a diferencia de cuatro residuos localizados en dos asas del dominio de oligomerización de la subunidad adyacente del dímero y que se sugiere participan en la unión del sustrato. Dentro de éstos se encuentra la H192, que constituye de manera comprobada la mitad del agujero del oxianión y aunque se ha propuesto que el CM2 es la otra mitad, la remoción del ion metálico por diálisis exhaustiva produce una metalo-isoforma que conserva el 50 % de su actividad, lo cual no es consistente con el papel sugerido. Identificamos que la H352 se encuentra en una posición adecuada para estabilizar el oxianión del estado de transición, pero esta hipótesis requiere de validación.