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El río Conchos es la principal fuente de agua superficial del estado de Chihuahua, cuenta con importancia económica, social, geopolítica y ambiental, además actualmente se encuentra en un proyecto integral para mejorar sus condiciones hacia el año 2050, para el bien de la población. Con un enfoque ambiental, el presente estudio se evaluaron las características fisicoquímicas y aislamiento de microalgas del agua superficial, así como concentración de metales pesados (XRF), y presencia de coliformes en sedimentos del rio en tres regiones de la cuenca del río (sierra, meseta y desierto) durante 3. Se detectaron 4 especies de microalgas y 2 coliformes con multirresistencia a antibióticos (≤ 3 grupos), así como concentraciones altas de aluminio (<200 ppm) y cloro (<20 ppm). En este proyecto, se identificaron bioindicadores fecales con resistencia antimicrobiana, características fisicoquímicas y metales pesados relacionados con contaminación antropogénica.